学院自1985年开始招收“流体机械及工程”硕士研究生，拥有动力工程及工程热物理一级学科硕士点（动力工程及工程热物理学科是四川省重中之重建设学科，并列入四川省首批“一流”学科建设行列）以及动力工程、水利工程硕士专业学位授予权。

学院建有“流体及动力机械”教育部重点实验室、“流体机械及工程”四川省重点实验室、“能源动力重大装备及技术”四川省“2011计划”协同创新中心、四川省泵行业协同中心、“流体机械”四川省高校重点实验室、“先进飞行器与动力”四川省高校重点实验室、“水电工程”四川省实践教学示范中心、西华大学-安德里兹国际水力机械研究中心、“能源与动力工程”实验中心、“新能源与动力”联合检测中心、“天然气水合物”联盟、“流体及动力机械”四川省科技创新研究团队、“能源与动力工程”四川省教学团队，并装备有国内外先进水平的教学和科研设备。还与国内外一些先进科研院所和大型企业建立了良好的合作关系，为研究生培养奠定良好的研究条件。

学院现有教师70余人，95.6％的教师具有博士或硕士学位。其中教授、副教授30余人，长江学者特聘教授2人，国家“特支计划”领军人才1人，国家突贡中青年专家1人，教育部“新世纪人才”1人，国务院政府特殊津贴专家4人，四川省“塔尖”人才1人，省学术和技术带头人3人，省“千人计划”人才2人，省突贡专家2人，二级教授5人。学院现有研究生导师30余人，在读硕士生120余人。

研究生招生专业目录：

1、动力工程及工程热物理（0807）、能源动力（专业学位）（0858）

01动力机械及工程

02流体机械及工程

03化工过程机械（油气化工机械）

04新能源技术与装置

05飞行器动力工程

06复杂流体力学及应用

07智慧能源动力系统

08水电工程及系统

2、土木水利（专业学位）（0859）

01水工结构及岩土工程

02水力学及河流动力学

03水文学及水资源

04水利工程建设与管理

05生态水利工程

06智慧水利工程

07水力机械系统及工程

3、能源经济与节能技术（1202J2）